Хубаво е наргилето да се почиства често. Средно на 2-3 пушения е достатъчно.

Да се сменя водата и се измива цялостно. Във вазата понякога се образуват наслоявания, когато се пуши и водата престои за по- дълго време.

Почистването също се отнася и за металната тръба, която трябва да се чисти заедно с всичко друго поради причината, че по нея полепват сажди и понякога тютюн.

Друга важна част която често се забравя и пренебрегва е маркуча. Той трябва да се почиства преди всяко пушене, защото е възможно да има налепи или аромат от предишно пушене, които могат да направят сесията ви не толкова приятна. Препоръчваме да миете предимно гумени маркучи, защото има голяма вероятност  маркучите от друг материал да се разпаднат след миене.

След като маркуча бива измит, той трябва да бъде продухан както и разтърсван докато не изпадне всичко.